Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms