Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Abcf3Q8K268 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms