Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FgbQ8K0E8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms