Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmgcll1Q8JZS7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms