Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms