Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sphk1Q8CI15 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sphk1Q8CI15 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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