Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rp1l1Q8CGM2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rp1l1Q8CGM2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rp1l1Q8CGM2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rp1l1Q8CGM2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rp1l1Q8CGM2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rp1l1Q8CGM2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rp1l1Q8CGM2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rp1l1Q8CGM2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rp1l1Q8CGM2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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