Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc43a2Q8CGA3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms