Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snx30Q8CE50 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snx30Q8CE50 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx30Q8CE50 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx30Q8CE50 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx30Q8CE50 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx30Q8CE50 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx30Q8CE50 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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