Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms