Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms