Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms