Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrif1Q8CDD9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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