Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf2Q8CB19 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf2Q8CB19 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phtf2Q8CB19 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf2Q8CB19 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms