Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C1R3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C1R3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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