Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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