Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc2Q8BZW8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc2Q8BZW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms