Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ube3dQ8BX13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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