Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms