Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm10600Q8BQ57 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm10600Q8BQ57 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm10600Q8BQ57 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm10600Q8BQ57 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm10600Q8BQ57 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm10600Q8BQ57 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10600Q8BQ57 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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