Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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