Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms