Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pknox2Q8BG99 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms