Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrsam1Q80ZI6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms