Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NanogQ80Z64 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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