Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Chn2Q80XD1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chn2Q80XD1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms