Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpp38Q80UU2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpp38Q80UU2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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