Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp8Q80U87 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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