Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms