Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pja2Q80U04 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms