Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms