Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms