Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sbno2Q7TNB8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms