Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcg2Q7TMS5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms