Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwistnbQ78WZ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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