Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms