Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trpv1Q704Y3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms