Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssx9Q6XAS3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms