Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms