Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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