Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms