Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCW6

Cnfn, Cornifelin, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnfnQ6PCW6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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CnfnQ6PCW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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CnfnQ6PCW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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CnfnQ6PCW6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnfnQ6PCW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms