Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms