Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms