Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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