Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms