Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpbp1Q6NXH3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms