Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms