Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NipblQ6KCD5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NipblQ6KCD5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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NipblQ6KCD5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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