Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms